Si un des fichiers est sur un serveur distant:
diff /home/fichier.txt <(ssh utilisateur@nom_serveur 'cat /home/fichier.txt')
Vous pouvez également utiliser le vimdiff (Ne pas oublier les doubles slash:
vimdiff /home/fichier.txt scp://nom_serveur//home/fichier.txt
Si les deux fichiers sont sur des serveurs distants:
diff <(ssh nom_serveur 'cat /home/fichier.txt') <(ssh nom_serveur2 'cat /home/fichier.txt')